Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CST1P01037 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CST1P01037 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CST1P01037 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CST1P01037 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CST1P01037 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CST1P01037 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms