Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TBX18O95935 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TBX18O95935 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBX18O95935 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBX18O95935 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBX18O95935 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms