Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNTO95613 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNTO95613 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNTO95613 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNTO95613 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNTO95613 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNTO95613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNTO95613 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms