Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYNGR4O95473 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYNGR4O95473 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms