Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP2O94887 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP2O94887 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP2O94887 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP2O94887 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARP2O94887 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARP2O94887 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARP2O94887 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP2O94887 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP2O94887 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP2O94887 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FARP2O94887 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARP2O94887 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARP2O94887 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP2O94887 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP2O94887 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP2O94887 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP2O94887 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARP2O94887 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARP2O94887 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms