Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VAMP4O75379 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VAMP4O75379 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms