Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP2O75323 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP2O75323 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms