Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG13O75143 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG13O75143 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG13O75143 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG13O75143 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG13O75143 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms