Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNASEH1O60930 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNASEH1O60930 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms