Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NOBOXO60393 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NOBOXO60393 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOBOXO60393 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NOBOXO60393 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOBOXO60393 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOBOXO60393 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOBOXO60393 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOBOXO60393 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOBOXO60393 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOBOXO60393 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOBOXO60393 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms