Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH6O60337 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH6O60337 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH6O60337 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms