Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX6O43752 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX6O43752 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX6O43752 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX6O43752 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX6O43752 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX6O43752 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX6O43752 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX6O43752 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX6O43752 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX6O43752 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms