Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GATCO43716 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GATCO43716 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GATCO43716 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GATCO43716 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GATCO43716 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GATCO43716 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GATCO43716 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms