Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNQ3O43525 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNQ3O43525 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms