Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
SYNJ1O43426 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SYNJ1O43426 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SYNJ1O43426 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms