Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSI1O43347 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSI1O43347 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSI1O43347 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSI1O43347 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSI1O43347 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSI1O43347 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms