Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PSMD3O43242 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD3O43242 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms