Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN2DO15399 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIN2DO15399 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms