Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FANCAO15360 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
FANCAO15360 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FANCAO15360 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FANCAO15360 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FANCAO15360 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FANCAO15360 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FANCAO15360 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FANCAO15360 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FANCAO15360 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FANCAO15360 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FANCAO15360 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCAO15360 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCAO15360 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FANCAO15360 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FANCAO15360 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FANCAO15360 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
FANCAO15360 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FANCAO15360 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FANCAO15360 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FANCAO15360 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FANCAO15360 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
FANCAO15360 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FANCAO15360 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
FANCAO15360 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FANCAO15360 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FANCAO15360 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FANCAO15360 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FANCAO15360 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCAO15360 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FANCAO15360 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FANCAO15360 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
FANCAO15360 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
FANCAO15360 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms