Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHUKO15111 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHUKO15111 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHUKO15111 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHUKO15111 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHUKO15111 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms