Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC27A2O14975 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC27A2O14975 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC27A2O14975 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms