Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IKBKBO14920 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IKBKBO14920 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms