Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIBO00712 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIBO00712 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIBO00712 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIBO00712 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIBO00712 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIBO00712 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIBO00712 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIBO00712 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIBO00712 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIBO00712 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIBO00712 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIBO00712 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms