Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PODXLO00592 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PODXLO00592 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PODXLO00592 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PODXLO00592 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PODXLO00592 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PODXLO00592 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PODXLO00592 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PODXLO00592 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PODXLO00592 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms