Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGRNO00468 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGRNO00468 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
AGRNO00468 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AGRNO00468 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms