Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3C2AO00443 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3C2AO00443 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms