Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QRE1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QRE1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QRE1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QRE1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3QRE1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3QRE1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QRE1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QRE1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QRE1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QRE1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QRE1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QRE1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QRE1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QRE1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QRE1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms