Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
I3L3M4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
I3L3M4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
I3L3M4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
I3L3M4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms