Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E9PBE3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E9PBE3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E9PBE3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PBE3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PBE3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PBE3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PBE3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E9PBE3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E9PBE3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms