Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HHLA1C9JL84 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HHLA1C9JL84 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms