Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf172C9J069 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf172C9J069 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms