Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B4E1Z4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
B4E1Z4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B4E1Z4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B4E1Z4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4E1Z4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4E1Z4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4E1Z4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4E1Z4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
B4E1Z4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
B4E1Z4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms