Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYSRT1A8MQ03 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYSRT1A8MQ03 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms