Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YJEFN3A6XGL0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YJEFN3A6XGL0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms