Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85CA6NKD9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms