Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCAF2A6NFQ2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms