Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POTEFA5A3E0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POTEFA5A3E0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms