Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC162PA2VCL2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC162PA2VCL2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms