Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FRMD3A2A2Y4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FRMD3A2A2Y4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms