Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBA6A0AVT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBA6A0AVT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms