Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCRBV7S3A2A0A539 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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TCRBV7S3A2A0A539 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TCRBV7S3A2A0A539 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TCRBV7S3A2A0A539 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV7S3A2A0A539 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV7S3A2A0A539 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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