Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A1W2PQD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1W2PQD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms