Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms