Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DENND2DQ9H6A0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DENND2DQ9H6A0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DENND2DQ9H6A0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DENND2DQ9H6A0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DENND2DQ9H6A0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DENND2DQ9H6A0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DENND2DQ9H6A0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND2DQ9H6A0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND2DQ9H6A0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND2DQ9H6A0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DENND2DQ9H6A0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2DQ9H6A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms