Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nol3Q9D1X0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nol3Q9D1X0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nol3Q9D1X0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nol3Q9D1X0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nol3Q9D1X0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nol3Q9D1X0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol3Q9D1X0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol3Q9D1X0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nol3Q9D1X0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms