Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAMP8Q9BV40 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP8Q9BV40 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP8Q9BV40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP8Q9BV40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP8Q9BV40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAMP8Q9BV40 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP8Q9BV40 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 405.9 ms