Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EpcamQ99JW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EpcamQ99JW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EpcamQ99JW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EpcamQ99JW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EpcamQ99JW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EpcamQ99JW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EpcamQ99JW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EpcamQ99JW5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EpcamQ99JW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms