Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAB3IPQ96QF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB3IPQ96QF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB3IPQ96QF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB3IPQ96QF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB3IPQ96QF0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB3IPQ96QF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB3IPQ96QF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB3IPQ96QF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms