Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD4Q5VWC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD4Q5VWC8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD4Q5VWC8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD4Q5VWC8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HACD4Q5VWC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACD4Q5VWC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACD4Q5VWC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms