Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC1Q15751 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HERC1Q15751 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HERC1Q15751 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERC1Q15751 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERC1Q15751 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC1Q15751 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERC1Q15751 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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